如不幸確診患上乳癌，醫生會根據臨床、影像和組織診斷報告為患者制定適切的治療方針。乳癌分為零至四期，是根據腫瘤的入侵性和大小，腫瘤入侵的淋巴結的總數和區域，以及遠端身體器官是否有轉移來決定的。根據《美國癌症聯合委員會》的最新乳癌分期指引，腫瘤的生物標記包括荷爾蒙受體，HER2 基因擴增和腫瘤分化級別（Grade 1-3）會被納入分期的考慮因素，因而提高了對病情預測的準確度以及能讓治療更加個人化。五類主要的治療方法包括外科手術、化學治療（化 療）、放射治療（電療）、荷爾蒙治療及標靶治療。近年更有較新發展的免疫療法，亦可結合其他治療一同進行。

對於0至3期的乳癌患者來說，手術屬於根治性療程，一般分為全乳切除或局部切除。全乳切除的患者可考慮手術中即時或後期進行重建手術，以還原外觀及提升自信心，而局部切除亦已有較新的「整形式乳房腫瘤切除術」（oncoplastic breast surgery）。手術包括乳癌切除（onco）及乳房整型（plastic）兩部分，藉由不同傷口切痕的設計及局部乳腺組織的移動，把乳腺組織「重新執位」，不但能確保腫瘤切除的安全邊緣，同時也達致重塑乳房外觀的效果。

在適合的情況下，患者若在手術前配合全身性治療，將腫瘤縮細後，也可提升手術選擇。這需要考慮到腫瘤的生物標記、患者的身體狀況和意願等等，以配合適當的術前治療方針。至於第四期患者，治療目的主要是舒緩性質，比較多使用全身性的療程，有時也會配合乳房手術以達到局部控制的效果及提升生活質素。

基因檢測是近年城中熱話，但大眾容易誤解和混淆乳癌腫瘤基因和遺傳性乳癌基因的分別。

乳癌腫瘤基因當中包括從不同方面和程度影響癌症表現和復發機會的基因，其中有影響癌細胞繁殖率或侵襲性的，也有對荷爾蒙或HER2表現有關連的。乳癌腫瘤基因測試是利用嶄新的科技對腫瘤組織內與癌症復發相關的基因進行分析，從而計算出一個復發指數。這個指數能更精準地提供乳癌患者術後的預後資訊（prognostic）包括復發率、存活率等等，亦具有預測性（predictive）因而能夠指導治療決策，識別哪些患者能夠於哪些治療獲益最大。

至於遺傳性乳癌基因是指一代傳一代的變異基因。遺傳的是可導致癌症的變異基因而非癌症本身。值得留意的是只有5%至10%的乳癌是因為遺傳的基因變異所引致的。而擁有基因變異的人雖然患癌的風險比一般女性為高，但也並不一定會患上乳癌，因為環境及後天的因素也會影響患癌的機率。遺傳性乳癌基因測試是測試身體上與生俱來的變異基因從而評估個別人士是否屬於高危一族。如果發現是高危一族，則建議較一般女性更早開始進行較為密集的乳房篩檢，在適合的情況下預防性手術也是一個可行的選擇。擁有一些個人或家族病歷史的人士可能有較高機會帶有遺傳性乳癌變異基因。這些包括早發性乳癌（45歲或以前確診），早發性卵巢癌（早於更年期以前確診），兩邊乳房皆有癌症，三陰性乳癌患者，變異基因攜帶者的直系親屬。